วันที่ 10มีนาคม 2566 จากกรณีที่ทางคณะรัฐมนตรี(ครม.) มีมติเห็นชอบโยกย้าย พล.ร.ต.สมเกียรติ ผลประยูร เลขาธิการศูนย์อำนวยการบริหารจังหวัดชายแดนภาคใต้ ไปเป็นดำรงตำแหน่งผู้ทรงคุณวุฒิประจำสำนักนายกรัฐมนตรี จนเกิดกระแสคัดค้านเป็นวงกว้างนั้น

ล่าสุดมีรายงานว่า นายนรุตม์ ธัญวงษ์ รองเลขาธิการคณะรัฐมนตรี ปฏิบัติราชการแทนเลขาธิการคณะรัฐมนตรี ได้มีหนังสือถึง พล.ร.ต.สมเกียรติ ผลประยูร เลขาธิการศูนย์อํานวยการบริหารจังหวัดชายแดนภาคใต้ (ศอ.บต.) เรื่อง ขอยกเลิกมติคณะรัฐมนตรี (ครม.) เมื่อวันที่ 28 กุมภาพันธ์ 2566 เรื่อง การโอนข้าราชการ พลเรือนสามัญเพื่อแต่งตั้งให้ดํารงตําแหน่งผู้ทรงคุณวุฒิพิเศษประจําสํานักนายกรัฐมนตรี

หนังสือดังกล่าว ระบุว่า ด้วยในคราวประชุมคณะรัฐมนตรีเมื่อวันที่ 7 มีนาคม 2566 นายวิษณุ เครืองาม รองนายกรัฐมนตรี เสนอว่า ตามที่คณะรัฐมนตรีได้มีมติเมื่อวันที่ 28 กุมภาพันธ์ 2566 อนุมัติรับโอน พลเรือตรี สมเกียรติ ผลประยูร ข้าราชการพลเรือนสามัญ ตําแหน่ง เลขาธิการ ศูนย์อํานวยการบริหารจังหวัดชายแดนภาคใต้ และแต่งตั้งให้ดํารงตําแหน่ง ผู้ทรงคุณวุฒิพิเศษประจํา สํานักนายกรัฐมนตรี (นักบริหารระดับสูง) สํานักงานปลัดสํานักนายกรัฐมนตรี สํานักนายกรัฐมนตรี ตั้งแต่วันที่ทรงพระกรุณาโปรดเกล้าโปรดกระหม่อมแต่งตั้งเป็นต้นไป ตามที่นายวิษณุ เครืองาม รองนายกรัฐมนตรี เสนอนั้น

เพื่อให้การบริหารราชการแผ่นดินของศูนย์อํานวยการบริหารจังหวัดชายแดนภาคใต้เป็นไปด้วยความเรียบร้อยและต่อเนื่อง จึงขอเสนอคณะรัฐมนตรีพิจารณาอนุมัติยกเลิกมติคณะรัฐมนตรี เมื่อวันที่ 28 กุมภาพันธ์ 2566 เรื่อง การโอนข้าราชการพลเรือนสามัญเพื่อแต่งตั้งให้ดํารงตําแหน่ง ผู้ทรงคุณวุฒิพิเศษประจําสํานักนายกรัฐมนตรี (พลเรือตรี สมเกียรติ ผลประยูร) และให้คงอยู่ปฏิบัติหน้าที่เดิม ต่อไปอีกไม่เกิน 1 ปี ตามมาตรา 58 แห่งพระราชบัญญัติระเบียบข้าราชการพลเรือน พ.ศ. 2551 คณะรัฐมนตรีพิจารณาแล้วลงมติอนุมัติตามที่รองนายกรัฐมนตรี (นายวิษณุ เครืองาม) เสนอ จึงเรียนมาเพื่อโปรดทราบ